ドルモン レベル：成長期 獣竜型 データ種
（＝ドルガモン） レベル：成熟期 獣竜型
（＝ドルグレモン） レベル：完全体 獣竜型
（＝アルファモン） レベル：究極体 聖騎士型 ワクチン種
・体内にＸ抗体と呼ばれるプログラムを持つこの物語の主人公。出生に秘密があり、デジタルワールドの運命を握っている存在。
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オメガモン レベル：究極体 聖騎士型 ワクチン種
（＝オメガモンＸ）
・主君「イグドラシル」の命によりプロジェクトアークと呼ばれるデジモン粛清計画を遂行する。
デュークモンとは盟友の仲であり、彼と並んでロイヤルナイツ最強の存在。
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ウォーグレイモンＸ レベル：究極体 竜人型 ワクチン種
・両手に装備したドラモンキラーで闘う竜戦士。レジスタンスのリーダーとしてイグドラシルと敵対する。
体内にドルモン、メタルガルルモンと同じＸ抗体を持つ。
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メタルガルルモンＸ レベル：究極体 サイボーグ型 データ種
・全身に武器・重火器を装備したサイボーグ型デジモン。レジスタンスの穏健派だが、ドルモンに攻撃をしたオメガモンの行動を見て、参戦する。
体内にドルモン、ウォーグレイモンと同じＸ抗体を持つ。
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トコモン レベル：幼年期
（＝トコモンＸ）
・レジスタンスと選ばれたデジモンとの会合の際の生き残り。
ウォーグレイモンが預けてからドルガモンがさらわれるまで彼と行動を共にしていた。
一度Ｘプログラムに感染するがメタルガルルモンからＸ抗体を受け継ぎ一命を取り止めた。
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デュークモン レベル：究極体 聖騎士型 ウィルス種
（＝デュークモンＸ）
・イグドラシル直属の組織、ロイヤルナイツの一員。
イグドラシルの考えに早くから疑問を持ち、ロイヤルナイツを裏切る。その結果盟友・オメガモンに粛清される。が・・・・
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■■■用語解説■■■
デジタルワールド
・ネット内に広がるデジモンたちの世界。
プロジェクト・アーク
・増えすぎたデジモンをニューデジタルワールドに少数のみ移住させ、残ったデジモンを消去する計画。
または全デジモンの完全消滅を目的とする『実験体デジモン』の使用のこと。
ニューデジタルワールド
・増えすぎたデータに耐え切れなくなったデジタルワールドを捨て、残りのデジモンを移送した世界。
過去＝ウルドターミナル、現在＝ベルサンディターミナル、未来＝スクルドターミナルで構成されている。
ロイヤルナイツ
・イグドラシル直属の精鋭組織。全部で13体の聖騎士型デジモンが所属する。
オメガモン、デュークモン、マグナモンはベルサンディターミナルを担当していた。
レジスタンス
・プロジェクトアークに反対する勢力。
当初はＸ抗体を手に入れニューデジタルワールドに逃げ込んできたデジモンで構成されていたが、デュークモンが計画の第2段階の事実を知らせてからは選ばれたデジモンもこの勢力に入っている。
プロジェクト・アークの真意
データ量が増えすぎたデジタルワールドはデジタルハザード、つまり崩壊の危機を迎えた。
デジタルワールドの管理者、イグドラシルはこの事態についにデジモンを粛清するという手段に出た。
まずニューデジタルワールドを作り、そこに厳選された少数のデジモンを移住させ、旧デジタルワールドにデジモンデータ破壊プログラム、通称『Ｘプログラム』『バーティクル・ワーム』と呼ばれるものを流した。
これによりデジモンはほぼ完全に抹消された。
しかしＸプログラムに対抗するＸ抗体を体内に作り出すことに成功したデジモン＝Ｘデジモンはニューデジタルワールドに逃れた。
イグドラシルはプロジェクトアークを第2段階に移行。ロイヤルナイツは全デジモンを粛清対象とした。このころからロイヤルナイツ内でも亀裂が生じ始め、デュークモンを初めとし、数体が粛清された。
ロイヤルナイツの粛清により、デジモンの生存数は半数程度まで減少する。そこでイグドラシルはプロジェクトアークを第三段階に移行した。『実験体デジモン』からＤＥＸと呼ばれるプログラムを抽出し、デクスドルグレモンを量産。生き残ったデジモンをさらに追い詰めさせた。同時にロイヤルナイツに粛清されたなかから特に能力の高いものをＸ抗体を与えた状態で再び参戦させた。
そしてイグドラシルはゲートを開くよう仕向け、自らのダミーを破壊されると同時にプロジェクトアークが完成するよう設定した。
つまりイグドラシルが厳選したデジモンと実力で生き延びたデジモンを集め、最後に生き残ったデジモンのみを『本当のニューデジタルワールド』に移送する。それによりデジモンの個体数を減らす。ニューデジタルワールドへデジモンを移送させる。さらに高い能力＝『数々の粛清に倒れず生き残ることのできるほどのデジモン』のみを生存させる。
これがプロジェクトアークの真意である。
（と、思う。この作品はあまりにもデータが少なく、セリフや関連資料に基づき管理人が推測したものです。したがって事実であるというわけではありません。）
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